Ekstrakurikuler pramuka merupakan kegiatan ekstrakurikuler yang wajib diikuti oleh seluruh siswa dari berbagai tingkatan kelas, yaitu kelas 7, kelas 8, dan kelas 9. Pelaksanaan ekstrakurikuler pramuka ini dilaksanakan setiap Selasa setelah semua siswa melaksanakan pembelajaran di kelas.
Pada kegiatan ekstrakurikuler pramuka di SMP Negeri 6 Tanjungpinang, siswa diberikan materi terkait kepramukaan yaitu mengenai pengamalan dasa darma, baris-berbaris, kedisiplinan, dan sebagainya.
Beberapa siswa dipilih menjadi anggota inti, dimana anggota ini yang merupakan perwakilan dari gugus depan ketika mengikuti kegiatan atau lomba di luar sekolah.